成立于1994年。心血管外科2003年7月与亚洲最大的心血管病专科医院中国医学科学院暨中国协和医科大学阜外心血管病医院联姻，设立北京阜外心血管病医院宝鸡技术协作中心，由北京阜外心血管病医院教授联合科室专家共同手术。该中心的成立标志着本地区心血管外科技术与北京阜外心血管病医院同步发展，达到了国内先进水平，手术量逐年增加，名列省内前茅，各类心脏直视手术的成功率99%，近、远期疗效达全国领先水平。