驻马店市中心医院肛肠科是集中西医为体治疗大肠肛门病的专业科室，拥有高级技术人才2名，中级技术人才3名，配备有导光肛门镜、直肠镜、乙状结肠镜、纤维结肠镜、电子结肠镜、数字胃肠机、多功能微波治疗仪、激光电离治疗仪、结肠息肉套扎器、高频电圈套式息肉切割器、吸扎式内痔套扎枪等系列先进设备。设有专科门诊及住院病区，病员辐射豫南一带及周边数省，年接诊及收治病人一万多人次。该科狠抓服务质量，注重人才培养和技术创新。近年共获国家发明专利一项．市级科技成果奖五项，发表专业学术论文50余篇，自行研制开发专科诊疗新项目10余项；其中填补国家级技术空白1项，省级技术空白3项，市级技术空白7项。如《盲肠粘膜柱状梯形缝扎、直肠周围三间隙固脱注射加肛门环缩术治疗重度直肠脱垂》填补国家技术空门。《粘固内注法治疗III期内痔》、《分段齿形剥扎、赘皮横切对口缝合术治疗环状混合痔》、《经会阴一期肛门成形术治疗先天性高位直肠闭锁》填补三项省内技术空白。另外《自制套扎器经肛门内镜下套扎治疗高位直肠及乙状结肠巨大息肉》、《负压吸扎式套扎枪快速治疗盲肠及乙状结肠息肉和内痔》、《一次性切开开放引流术治疗婴幼儿肛周脓肿及肛瘘》、《经肛门修补治疗直肠前突引起的顽固型便秘》、《中西结合系列组方治疗慢性溃疡性结肠炎》、《断管截根加外口缝合术治疗高位复杂性肛瘘》、《骶管阻滞法治疗肛门直肠神经官能症》填补七项本市技术空白。该科还肩负教学和培训任务，常年接收进修医师和医学院校实习生，已分批次为部队医院、国内五省市及本市县、乡级基层医院培养技术人才200多名。为搞好肛肠疾病的群防群治，推动本市肛肠专业水平的整体提高起到重要作用。肛肠科已经成为豫南一带医疗、教学和科研中心。