肛肠分院技术力量雄厚、设备先进、功能齐全，具有显著中医药特色和独特治疗方法，目前已成为全省西部地区肛肠疾病诊疗中心，国家级重点专科建设单位。设有床位200张，高间30个，下设五个科室。该分院拥有低温等离子肛肠治疗仪、大型痔疮综合治疗仪、新型微波治疗仪、超声中药熏洗椅、水疗灌肠仪等先进设备。高间内设电视、冰箱、多功能床、空调、淋浴器、沙发、电话和呼叫系统，配有高档全自动喷淋、冲洗、烘干坐便，环境整洁、优雅舒适。科室对痔、肛裂、肛瘘、肛痈等本地区常见病、多发病治疗效果显著，尤其对蹄铁型肛周脓肿、肛管狭窄及高位肛瘘 等疑难病的治疗达到省内先进水平；独创的洪宝膏、独效散、化腐生肌散、珍珠散、痔复康饮液等20余种中药制剂在肛肠疾患的应用中，疗效显著。