消化内科展开床位130余张，拥有电子胃镜、电子肠镜、电子十二指肠镜、导纳胃动力检测仪、C14UBT胃Hp感染检测仪、结肠灌注透析治疗仪、微波治疗仪、氩气刀等先进设备，功能齐全，总价值超过1000万元。消化内镜中心，面积1000多平方米，每年胃肠镜检查超过16,000例次，开展内窥镜下胃肠道的各类治疗术近1000例，其设施和规模在福建省地区属领先水平。 多年来科室始终以业务建设与科学研究并重，人才实力雄厚，梯次合理。拥有医护工作人员共40余人，其中博士生2人，硕士生3人，大学本科生15人。近5年来，共完成国家自然科学基金及福建省、漳州市科研基金资助课题研究5项，发表论文100余篇，参编专著2部，获军队地方科技进步奖5项。科室年收治病人3000余人次，门诊量30,000余人次。 通过长期的医疗实践，在消化道大出血、各种农药中毒抢救，脂肪肝、肝炎肝硬化、消化道肿瘤综合治疗，急性胰腺炎、胆总管结石的内镜微创治疗，以及消化道异物、胃十二指溃疡、溃疡性结肠炎、痔疮等疾病诊治，积累了丰富的临床经验。开展消化道各类支架植入、早期肿瘤内镜下剥离、息肉切除、内镜逆行胰胆管造影（ERCP）等技术，取得很好的疗效。