呼吸科是云南省唯一临床呼吸重点专科，至今已有34年的历史。现有医护人员47人。其中，教授、主任医师4人，副教授、副主任医师6人，主治医、医师 人，副主任护师 人，护师（士） 人。学科带头人、教授、主任医师黄祖佑是云南省医学会呼吸分会副主任委员、知名呼吸系疾病专家，在抗击非典斗争中，受中组部表彰。呼吸科拥有病床61张，配备设施先进完善的呼吸重症监护室（RICU)，睡眠监测室、肺功能室、血气分析室、肺病实验室、细菌培养室、气道反应室、肺功能室、纤支镜室、睡眠监测室、胸腔镜室等。在呼吸系统疾病的基础研究及提高临床诊治水平方面，发挥着积极的作用。呼吸系疾病是内科的常见、多发病，具有较高的发病率、致残率。针对常见病、危重病和疑难病，呼吸科建立了一整套科学规范的诊治常规，使呼吸系疾病的诊治水平以及在国内省内的学术地位有了显著提高，尤其是慢性阻塞性肺病（COPD）、支气管哮喘、弥漫性肺间质疾病、肺癌、呼吸衰竭、胸膜疾病等的诊治达到国内先进水平。每年接收省内外专科进修医护人员5060人，是省内集临床、科研、教学为一体的省级重点专科。多年来，呼吸科根据学科发展需要，及时跟踪国内外呼吸系疾病及相关领域的最新进展，结合科室特点，把成熟的新技术、新业务应用到临床。开展科技攻关，取得多项科研成果，如《经鼻和经口气管插管抢救（COPO）呼吸衰竭的比较研究》、《支气管哮喘与呼吸系疾病气道高反应性鉴别》获省科技进步奖，另获卫生厅科技进步奖多项。每年有多篇论文在国家级及省级专业刊物上发表，为适应临床需要，出版了《呼吸临床急症学》。