第三军医大学新桥医院呼吸内科是国家级重点学科、中国人民解放军呼吸内科研究所、全军重中之重建设学科、重庆市高校重点学科、重庆市医学领先学科和重庆市人类疾病基因研究所;临床医学博士后流动站、呼吸内科博士学位授予点;国家药物临床试验机构呼吸专业。其实验室是中国人民解放军呼吸疾病基础研究重点实验室和重庆市重点实验室。本学科点分为病房及实验室两部分，展开床位110张，拥有一栋面积2025平方米的实验大楼，各类专用仪器设备价值3380万元。本学科现有科技人员51名,其中教授6名,副教授6名,博士生导师5名，硕士生导师4名，具有博士学位35名，共招收培养博士后10名，博士110名，硕士125名，进修生205名。获得国家科学技术进步二、三等奖各1项、军队及省部级科学技术进步一等奖1项、二等奖20项、军队医疗成果一等奖2项、二等奖2项、军队教学成果二等奖1项。第三军医大学新桥医院呼吸内科前身为西南军区总医院结核科，成立于1950年。1978年开始组建呼吸专科中心，单独设立病房，开展床位40张，同年被批准为呼吸内科硕士学位授予点。1984年被批准为全军呼吸专科中心，1986年被批准为呼吸内科博士学位授予点，1995年被评为四川省重点学科，并于当年升格为全军呼吸内科研究所。1996年启动了临床医学博士后流动站，其实验室1996年被评为四川省呼吸疾病基础研究实验室和全军呼吸重点实验室，。1999年评为重庆市重点学科和重庆市医学领先学科，实验室被批准为重庆市重点实验室和重庆市人类疾病基因研究所。2001年被批准为呼吸内科国家重点学科，2007年通过国家重点学科的复审。2007年建立了第三军医大学呼吸病专科医院。