手术室成立于建院初期，经过多年的发展已经颇具规模。现有医护人员11人，其中：麻醉医生3人、护士7人、护工1人；中级职称4人，初级职称6人。 设有手术台3间，能配合脑外、普外、骨外、妇产科、五官科、口腔科等手术科室，能同时进行两台全麻手术。各手术间配套设备齐全，有空调、暖气、子母无影灯、带摄像机手术无影灯，升降式手术台。氧气及吸引装置等，并拥有北美多功能麻醉机一台，日本木村麻醉机一台，多功能监护仪两台，熊牌1000型呼吸机一台，进口高频电力、又极电凝、冷光源灯、电钻等先进医疗设备和手术器械。能够应用麻醉镇痛技术，实施硬外麻醉、腰麻、腰硬联合麻醉、骶麻、单纯静脉全麻，颈丛、臂丛及其它神经阻滞麻醉等，各种麻醉方法，可满足产科、妇科、普外科、泌尿外科、骨科、五官科、口腔科等各科手术麻醉的要求，工作中严格执行无菌操作技术及消毒、隔离制度，术后认真执行查对制度，多年来从未发生一起差错事故及感染，在保证手术量的同时，配合医院各科开展新、精、难的手术，近两年手术室又协助各专业外科开展了术后镇痛，无痛人流术及微创腹腔镜技术。为提高西藏地区医疗水平起到了推动作用。