甘肃省中医院消化科独立建科于1994年，经10余年的发展。消化科现系国家中医药管理局十一五重点专科建设单位、甘肃省临床医学重点学科、甘肃省中医管理局中医重点专科，具有国家药物临床试验机构中医消化专业资格。科室坚持中、西医双重诊断，发挥中医专科专病优势，采取中药针剂静滴、中成药及汤剂内服、中药煎剂保留灌肠、中药外敷、内镜下中药喷洒等具有中医特色的中医综合治疗手段，形成了一套中医特色鲜明的集抢救、治疗、康复、预防为一体的消化疾病治疗模式。优化了3个病种(慢性胃炎、消化性溃疡、肝硬化)诊疗方案，实现了专科独有医疗特色。在慢性胃炎、消化性溃疡、肝硬化、溃疡性结肠炎、功能性胃肠疾病等治疗优势明显。科室研制8种院内自制剂(制萎扶胃丸、健胃清肠合剂、健胃消胀合剂、健胃止血合剂、健胃止泻合剂、健胃消食合剂、运脾颗粒、清宁胶囊)，目前在院内均已广泛应用。科室坚持医、教、研三位一体的发展模式，经过多年发展建设，建立了一个省级2级实验室，现已成为临床技术力量雄厚、人员结构合理、科研学术水平较高、人才培养层次较多的优秀临床基地，在我省居于同行前列，并具有较大的影响力。科室现配有奥林巴斯内窥镜系列3套(GIF260,包括胃镜、经鼻胃镜、肠镜、十二指肠镜、超声内镜、NBI内镜)、幽门螺杆菌检测仪、肝病治疗仪、胃肠动力治疗仪、高频电刀、氩气刀、多功能监护仪等设备，总价值逾500万。现有省级实验室(II级)1个，为临床诊疗和科研提供了可靠的保证。