急性传染病科是医院重点建设科室，鄱阳湖生态经济区突发急性传染病救治中心，主要收治和研究各类急性传染性疾病，如SARS、人禽流感、手足口病、暴发型流行性脑脊髓膜炎、重型流行性乙型脑炎、流行性出血热、霍乱等。该科业务主任陈家鸰教授是南昌市首批名医，南昌大学医学院教授，硕士研究生导师；科主任陈宏义为传染科学科带头人，主任医师、副教授。急传科医护人员共25人，其中研究生学历3名，主任医师2名，副主任医师2名，主治医师4名，主管护师4名。现有病床50张。科主任陈宏义为南昌市医院管理学会传染病分会委员，江西省感染病学会主任委员，业务主任陈家鸰为南昌市首批名医，具有较强的专业梯队。科室拥有德国进口的费森尤斯血液透析仪，能开展急性传染病合并肾衰竭的血液透析治疗及肝硬化等顽固性腹水的浓缩回输治疗。科室现收治各种原因代偿期及失代偿期肝硬化如肝炎后肝硬化(乙肝、丙肝等)酒精性肝硬化，胆汁淤积期，肝硬化，血吸虫性肝纤维化，自身免疫性肝硬化)及不明原因黄疸等病人，对该类病人能及时作出鉴别诊断及治疗，还收治流行性出血热，流行性脑脊髓膜炎，流行性脑膜炎，急性细菌性痢疾及中毒性痢疾，麻疹，流行性腮腺炎，水痘等急性传染病。对于各种危重症如大出血、休克、脑水肿、脑炎、肺水肿、颅内出血等的抢救治疗有丰富经验，是全省各种疑难及不明原因急性传染病的诊疗和救治中心。