市中医院肛肠科创建于1984年5月，该科室经历多名老专家的艰苦创业，科室从小到大，从弱到强，现已成为院重点专科。该科室现有专业技术人员6名，其中高级职称2名，科室所有人员均经浙一医院肛肠外科进修，有扎实的专业基础知识和临床实践经验，目前能进行各种大肠癌根治手术，低位直肠癌保肛手术。腹腔镜下全结肠切除术，腹腔镜直肠癌根治术。各种肛瘘、内外瘘及混合痔治疗处于全市领先水平。科室采用中西医结合治疗手段，疗效显著，已在全市人民心目中树立起较高的声誉。该科为方便广大患者就医，使患者在本院能享受省级医院专家的技术，还与浙一医院肛肠外科联合建立合作治疗中心，每月第一个星期日特聘浙一医院肛肠外科主任林建江教授来市中医院门诊及指导手术。