小儿外科包括新生儿外科、小儿普外科、小儿泌尿外科、小儿骨科和小儿肿瘤外科。服务对象是14周岁以内的需外科治疗的患儿。小儿外科现有专业外科医师9名，其中正、副主任2名、主治医师2名、住院医师4名，是海南省内技术力量最强的小儿外科专业队伍。每年收治小儿外科病儿900例左右，能常规开展小儿的多种大、中型手术，每年手术约600台(例)。绝大多数小儿外科疾病可以不出岛即能得到专业小儿外科医师的诊治。小儿外科诊治的常见疾病包括：先天性食道闭锁、先天性肠闭锁、环状胰腺、先天性肛门闭锁、先天性肥厚性幽门狭窄、先天性腹裂、脐膨出、先天性膈疝、先天性胆总管囊肿、胆汁粘稠综合征、先天性肠旋转不良、先天性巨结肠、腹股沟斜疝；甲状舌管囊肿、腮源瘘道、先天性肾积水、尿道下裂、肾输尿管重复畸形、隐睾、鞘膜积液；先天性肌性斜颈、髋脱位、脑瘫、马蹄内翻足、脊柱裂脊膜膨出、小儿腹腔肿瘤、骶尾部畸胎瘤、各种类型的血管瘤。