上海交通大学医学院附属第九人民医院药剂科是以药品采购、处方调配、制剂生产、静脉配置、临床药学及药学科研为一体的综合性医技科室，现有药学岗位人员120人（研究生学历15人），其中高级职称7人，中级职称41人（医院聘任）。结合学科建设和临床实际的需要，药剂科设有药库、门诊药房、急诊药房、发热药房、感染科药房、口腔科药房、中药房、住院药房、手术室药房、静脉药物配置中心、制剂室、分析室、临床药学室、药物研究室等部门。常规开展临床血药浓度监测、肿瘤药敏检测、临床用药咨询等药学服务工作。科室拥有自动发药机、药品全自动分包系统、电子针药柜等设备，为提高药师服务效率给予有力保障。在医院信息科的支持下，药剂科开发了一系列合理用药软件，抗菌药物合理使用监控软件、处方点评软件等，并不断完善。科室各部门均建立了完整的组织体系，确保学科建设扎实推进，使药学服务的质量与水平满足政府医改和医院工作的需求。科主任原永芳现为上海交通大学医学院药理学博士生导师，具有30年丰富的医院药学工作经验，在药物分析、药代动力学、药物分子机制等方面具有扎实的理论基础和丰富的研究经验，2008年8月-2009年1月赴加拿大多伦多大学作高级访问学者。主持国家自然基金、上海市科委基金、上海市教委基金、上海市卫计委基金等各级课题共计20余项，以第一作者及通讯作者在国内外期刊发表学术论文70余篇，其中SCI收录14篇；参编专著6部；授权专利1项。专职临床药师已涵盖呼吸内科、心内科、肾脏内科、肿瘤科、消化内科、内分泌科等临床科室。临床药师积极参与查房、会诊及病例讨论，参与制定个体化用药治疗方案，提供患者用药教育，药物咨询，开展药物不良反应监测等。同时不断深化药学服务的内涵，开展拆零药品说明书、药师服务名片、家庭备药清单和废旧药品回收等服务，得到了患者和医生的认可与好评，并获得了多项荣誉。临床药师还定期到社区、老年大学和民工子弟小学讲解合理用药常识，让更多的居民百姓们获益。药剂科每年承担上海交通大学口腔医学院《口腔临床药物学》等教学工作，承担复旦大学药学院、上海中医药大学、上海健康医学院、蚌埠医学院等学校实习生的带教任务。