眼科为中日友好医院中西医结合科室,是医院“中西医结合学科群”的重要组成部分;眼科目前承担“金明国家级名老中医工作室”、北京市“中医眼科特色诊疗中心”、“重点实验室-过敏性疾病中药防治研究中心”、“院级糖尿病重点实验中心”等工作,曾是中华中医药学会眼科分会主委单位,目前是中国中药协会眼保健技术专委会主委单位,并且是国家卫建委直属医院眼科教学联盟成员之一。科室医生在职人员21人,60%具有博士以上学位。团队有国家级名老中医1位,学科带头人1位;博士生导师2人,硕士生导师2人。目前科室分成8个亚专业,分别针对复杂眼底病变、眼外伤、视神经疾病、免疫性眼病、小儿眼病、青光眼、眼视光疾病、神经眼科等进行研究。科室为北京中医药大学博士及首都医科大学硕士培养点,肩负着北京大学医学部、协和医科大学、北京中医药大学、首都医科大学等多所院校的教学工作,包括本科生和研究生、师承教学、进修生教学、住院医师基地培养等多种教学任务,并先后承担和参加国家和部局级课题研究多项,近5年连续获得省部级科学技术奖二等奖1次,三等奖1次。科室设置床位30张,有配套且完善的眼科功能检查室及规范的中西医结合临床路径。除了能开展复杂眼底病变、复杂眼外伤、全飞秒激光及准分子激光近视矫正等手术治疗,近年来逐渐形成“以先进检查仪器为条件;以精准眼科影像学操作、阅片分析技术为基础;在中西医结合方面依托国家级名老中医工作室、北京市中眼科特色诊疗专科及神经眼科联合门诊做了大量工作,既开展了多项中医眼科多项传统技术,有在中西医融合方面极具特色与优势。对眼底病年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、眼底血管性病变、眼底免疫性病变及干眼症等中医药擅治病种或与中医临床相关中药技术形成系统性诊疗规范,充分发挥中西医协同优势,从疾病预防、诊断、治疗、康复和宣教等方面入手,同时牵头各临床医疗单位编写高质量循证指南,坚持创新与继承相结合,医教研相结合,通过近年的建设,已初步建成一个中医优势突出、传统中医诊治特色鲜明、中西医并重、具有示范带动作用的中医眼科重点专科。