新华医院神经外科是上海交通大学医学院以及新华医院的重点学科，是上海交通大学颅神经疾病临床诊治中心的组长单位，世界颅神经疾病外科医师联盟（WNFCND）轮值主席单位。目前拥有两个病区和一个独立的神经外科ICU，总病床数108张。年手术量超过3600台；在职医护人员70人，其中医师24名，主任医师4名，副主任医师8名，博士生导师2名，硕士生导师6名，在读博士和硕士研究生有10余名。病区共有8个亚专业，涵盖了神经外科的所有诊断与治疗，其中颅神经疾病、面瘫及神经损伤与修复、视网膜母细胞瘤的介入治疗，均已达到国内先进水平；脑缺血的手术介入治疗、脊髓脊柱及骶管囊肿等也已名列上海市前三位。医疗特色经过30余年的发展，神经外科具备了较强的医疗技术实力，已经成功开展了神经外科各个领域的技术项目，全年手术量超过4000台。主要医疗特色包括：颅神经疾病（三叉神经痛、面肌痉挛、舌咽神经痛、耳鸣、眩晕症、咬肌痉挛、周围性面瘫、面瘫后遗症、带状疱疹后遗症等）的微创治疗，颅脑肿瘤（垂体瘤、颅咽管瘤、脑膜瘤、胶质瘤、听神经瘤等）的显微外科治疗，脑血管疾病（动静脉畸形、动脉瘤、海绵状血管瘤、动脉狭窄、脑梗塞、脑供血不足等）的血供重建手术，脊髓与脊柱外科（包括椎管神经鞘瘤、血管瘤、骶管囊肿、压缩性骨折等）微创治疗，以及脑积水、眼睑痉挛、梅杰综合征、痉挛性斜颈、顽固性疼痛、癫痫、糖尿病周围神经病变等疾病的外科治疗。作为上海交通大学颅神经疾病临床诊治中心，近年来围绕颅神经综合症的发病机制、现有诊治技术的完善以及新技术开发进行了系列研究，取得了多项成果。比如提出和验证了交感神经的桥接学说，第一次发现了交感神经在面肌痉挛等颅神经疾病发生中的关键作用；发现并建立了ZLR监测技术，并提出AMR-ZLR-EMG联合监测技术，显著提升了面肌痉挛的治疗效果；提出采用五区探查和全程减压法治疗三叉神经痛和面肌痉挛，手术有效率达到98%，总体治疗效果达到了国际领先水平；采用小脑裂入路治疗三叉神经痛、采用小脑绒球下入路治疗面肌痉挛和舌咽神经痛，手术并发症显著下降；建立了舌下神经与颈神经联合移植治疗周围性面瘫的新技术，大大改善了患者术后的生活质量；在国际上第一次建立了颅外面神经松解术治疗痉挛性面瘫后遗症的新技术，开创了痉挛性面瘫后遗症外科治疗的先河，手术有效率超过80%；首先建立了双侧三叉神经和面神经梳理术治疗梅杰综合征的新技术，目前已经在全国广泛推广，产生了巨大的社会效益。目前颅神经疾病的年手术量已超过1500台，位居全国前列。同时，在中枢神经系统的围手术期功能监测与保护、微创神经外科、以及采用低温等离子射频技术治疗腰椎间盘突出症、带状疱疹后遗症等方面积累了丰富的经验。采用改进的颅底手术入路技术治疗颅咽管瘤、侵袭性垂体瘤和脑膜瘤，也取得了令人满意的疗效，降低了手术并发症。科研教学除繁忙的临床工作外，科室还承担了30余项包括国家自然科学基金在内的各类省部级科研项目，已经发表学术论文300余篇，其中SCI收录论文160余篇。曾荣获卫生部科技进步三等奖、上海市科技进步二等奖（两项）、教育部科技进步二等奖、华夏医学科技进步奖二等奖，上海市临床医疗成果二等奖、上海市生命科学奖、上海市医学银蛇奖、上海市医学科技奖（两项）等。出版学术专著7部：《微血管减压术治疗面肌痉挛临床病例荟萃》、《微血管减压术治疗三叉神经痛临床病例荟萃》、《微血管减压术治疗面肌痉挛》和《Microvascular Decompression Surgery》（Springer出版社）。并涌现出了一批青年学术骨干：上海市领军人才、上海市医学领军人才、上海市劳动模范、上海市医务工匠、第八届中国医师奖、教育部新世纪优秀人才、上海市曙光学者、上海市优秀学科带头人、上海市科技启明星、上海市浦江人才、上海市卫生系统优秀学科带头人等，为科室的发展奠定了坚实的基础。同时神经外科也与国外多家医学中心建立了合作与交流关系，包括意大利罗马凯瑟琳大学附属医院神经外科（Ferenandez， Visocchi）、美国匹兹堡大学附属医院神经外科（Kassam， Lunsford）、美国霍布金斯大学医学中心（Dellon）、美国密西根大学附属医院神经外科（Sagher）等。科室每年都主办学术会议或专题学习班， 如2006年的上海国际神经外科高峰论坛、2007年的中国意大利学术交流会议、2008年的国际神外科学会议、2010年的以来的第一届至第九届东方神经外科高峰论坛等，极大地提升了学科在国内外的影响力。此外，与2017年科室牵头联合美国、英国、法国、德国、加拿大、意大利、新西兰、韩国、日本、沙特等多个国家的神经外科医师成立了世界颅神经外科医师联盟（WNFCND）这一世界性的学术组织，并担任该组织的主席单位。经过几年的发展，目前WNFCND 已经成为在颅神经疾病外科领域最具影响力的国际性学术组织。