层重庆医科大学附二院肝胆外科系重庆市肝病治疗研究中心的支柱科室之一。创建于1960年，在我国著名肝胆外科专家李世英、高根五等老一辈专家的领导下，经过几代人的艰苦创业，科室不断发展壮大，1998年被确立为重庆市重点学科，分别于1998年、2001年成为博士学位授权学科和临床医学博士后流动站，2002年成为重庆市微创外科中心。 现已成为集医疗、科研和高层次人才培养为一体的大型肝、胆、胰、脾疾病治疗中心，拥有床位70余张，年收治病人2000余人次，年开展手术1500余台,并成为美国史赛克腹腔镜“川、渝、黔”技术人员培训中心。 科室坚持依托医院优势创特色，通过拓宽专科内容，丰富专科手段，增强专科功能，提高专科水平，在不断推进学科建设的同时，使自身专科特色更为鲜明。科室拥有国内一流的先进诊疗设备，包括电子纤维十二指肠镜、胆道镜和多功能电视腹腔镜、射频消融治疗仪等，已形成以外科病房、重症监护病房和肝胆外科实验室为要素板块，人才、技术、设备为支柱平台，肝、胆、胰、脾和门静脉高压症的外科治疗为主要内容，电视腹腔镜胆囊切除术、胆道镜和纤维十二指肠镜“三镜”治疗胆胰疾病及门静脉高压症与肝癌的手术治疗为技术特色，肝移植为重点研究发展目标的合理布局。 科室医生诊疗技术先进，在肝胆疾病微创手术治疗、肝硬化的外科手术治疗及复杂胆道疾病的治疗方面优势突出。现任科主任及微创外科主任龚建平教授系重庆市最早开展腹腔镜胆囊切除术的创始人之一，创造了10000余例手术无并发症的记录。高根五教授早在上世纪70年代便创立了治疗肝硬化、门脉高压新术式“经胸门奇断流术”并沿用至今。科室在肝胆及胰腺肿瘤，急性重症胰腺炎，肝胆管结石及胆管损伤等复杂肝胆胰疾病的治疗上也积累了丰富的经验，取得了优良的疗效。近年来已成功开展了各种肝移植手术，标志着科室在肝、胆、胰、脾及门脉高压症等疾病的外科治疗方面已达国内先进水平。作为高层次人才的重要培养基地，科室现已发展成为重庆市重点优势学科，硕、博士点和临 床医学博士后流动站，现有教授及博士生导师4人，副教授5人，主治医生4人，技术力量雄厚，人才结构合理，45岁以下的中青年医师全部为博士以上学历。迄今已招收培养博士后5名、博士生21名、硕士生30余名，同时累计培养进修生200余人次。所属肝胆外科实验室系重庆市重点医学专科实验室。 科室在科研方面硕果累累，在肝硬化、肝癌及枯否细胞的生物学行为等应用基础研究方面取得了一系列具有重要理论意义和实用价值的学术成果，多次获省市科技成果奖，迄今已在国内外各种刊物发表论文200余篇，主编或参编外科专著五部，获国家自然科学基金资助8项，每年获各类科研经费60余万元。目前综合实力处于西南领先地位，且取得了良好的社会和经济效益。