该科系儿童医院重点学科，属于我国最早成立的小儿神经专科，现设有由神经专科病房、知名专家及专科门诊、“重庆医科大学小儿脑瘫康复中心”、“重庆医科大学儿童癫痫诊治中心”、小儿临床神经电生理研究室、神经组织病理研究室等6个部分组成，是集医疗、教学、科研为一体的完整专业体系。科内现有博士生导师2名，自1986年，硕士生导师5名。自1986年起，已培养博士研究生12名、硕士研究生近40名;每年培训来自全国的专科进修生12～18人，1996年起被批准为卫生部(国家级)小儿脑电图与小儿神经疾病继教学习班，连续举办学习班7期，共培训包括澳门和北京地区在内的专业学员300余人。成为国内小儿神经专业人才的培训基地。