南京总医院心血管内科成立于1978年，是医院最早建立的科室之一。1997年升格为南京军区心血管病研究所，现有床位44张，工作人员30人，正高3人，副高级职称3人，中级职称9人，博士学位2人，硕士学位9人。该科设备先进，有功能完善的冠心病监护病房，病区内设有心导管室，配备进口新型心血管专用DSA及多导电生理仪，可在病房内进行冠状动脉造影、PTCA及支架植入术、二尖瓣狭窄经皮穿刺球囊成形术、心脏起搏术、射频消融术等各种心血管介入性诊疗操作，并备有中心工作站，每年完成心脏血管介入诊断治疗手术400余例。该科50年代在国内较早开展心脏导管检查术，迄今完成心导管检查术5000余例，心脏起搏900余例，二尖瓣成形术500余例，冠状动脉造影、PTCA及支架术400余例，射频消融术400余例，多项达国内先进、军内领先，每年收治心血管患者1500余例，对高血压、冠心病、心脏瓣膜病、心力衰竭、心律失常、各种心血管疑难杂症的诊断和治疗均有丰富经验。该科是第二军医大学和南京大学医学院硕士学位点及南京大学医学院博士学位点，注重学术研究，共发表论文600余篇，编写专著10余部，获得军队科技进步二等奖1项，三等奖20余项，担任军队及地方各种学术职务20余人次。