南京军区总医院神经外科组建于1955年，当时是隶属于外科的一个组，1984年正式建立神经外科，1996年被批准为南京军区神经内外科研究所，并于1998年更名为南京军区神经科学研究所。该研究所外科部（神经外科）现有医务人员44名，包括医师18名，其中主任医师6人，副主任医师5人，博士5人，硕士3人。展开床位52张，神经外科专科监护病房12张，年收容量超过1000人，年手术量900例左右。科室拥有万元以上设备14套，总价值超过700万元。该科在脑血管病、颅底肿瘤、功能性神经外科和颅脑损伤等手术和科研方面积累了丰富经验。近5年在医、教、研方面获得了丰硕成果，获国家科技进步2等奖一项，军队科技进步二等奖3项，军队科技或医疗三等奖 8项。