南京军区南京总医院泌尿外科于1946年由我国泌尿外科学奠基人之一的许殿乙教授等专家创建，前身是国立中央医院泌尿外科，在我国较早地开展了泌尿及男性生殖系统疾病的专科诊疗工作。目前拥有两个护理单元共66张床位，医疗、护理和技术人员共40人，是硕士研究生和博士后培养单位。 科室拥有体外震波碎石机、钬激光治疗仪、气压弹道碎石机、微波治疗仪及B超诊断仪等多种诊断治疗设备，广泛开展了包括经尿道膀胱电切镜及输尿管镜手术、腹腔镜下后腹膜器官的各种手术、经皮肾镜手术、钬激光肿瘤切除及碎石手术等等多种泌尿外科微创手术，在前列腺疾病、泌尿及男性生殖系统肿瘤、尿路结石及肾上腺疾病的诊断和治疗上具有特色；在尿流动力学方面进行了广泛深入的研究。所开展的各种开放及微创手术处于先进水平。