该科设立床位30张；另拥有先进的层流净化病房，床位数3张。该科在小儿血液病的临床研究和诊治方面有较高的水平，对白血病、特发性血小板减少性紫癜、血友病、地中海贫血、再生障碍性贫血、缺铁性贫血等疾病的诊治具有十分丰富的临床经验，治疗手段先进。此外还收治各种原因引起的贫血，肝脾淋巴结肿大、血三系减少及长期发热病人。一些疑难罕见病例（如尼曼匹克病、组织细胞增多症、嗜血细胞增多综合症）及重症传单、再障、严重溶血亦能得到及时确诊及治疗。该科在化疗方面取得的疗效显著，对于儿童常见的血液系统恶性肿瘤急性淋巴细胞白血病的缓解率可达90%以上。在干细胞移植方面，于1997已将自体干细胞移植术用于治疗儿童恶性淋巴瘤并获得成功，早年治疗的病例术后良好，目前更向脐带血移植方向迈进。