福建省立医院肿瘤科成立于1959年，是省内最先成立的肿瘤专科，也是省科技厅优先发展学科。拥有独立的专科门诊、病房及肿瘤随访室，并附设有乳腺疾病诊疗中心。开展以外科治疗为主，化疗和免疫治疗、内分泌治疗为辅的恶性肿瘤综合治疗，主要诊治疾病有胃癌、乳腺癌、肠癌、肝癌、头颈部肿瘤、腹膜后肿瘤、软组织肿瘤等。在全省率先推广恶性肿瘤规范化术式及综合治疗，先后开展巨大肝癌切除术、胃癌联合脏器切除术、全直肠系膜切除、直肠癌超低位切除吻合、乳腺癌哨兵淋巴结活检术、乳腺癌改良根治术后一期乳房重建术、经腹腔镜结肠癌根治术，胃癌哨兵淋巴结活检术等肿瘤诊疗新技术，在胃癌治疗上，手术切除率为87.11％左右，五年生存率为52.82％，达到“省内领先，国内先进水平”。