为推进健康管理学科发展，厦门大学附属中山医院于2014年3月成立“健康医学部”，下辖“体检一科、体检二科、特需门诊”三个医疗保健业务单元。医院另设有二个楼层的“特需病房”，挂靠干部保健科。依托三级甲等医院的综合实力，汇聚医院顶级专家团队和先进医疗设备资源，打造“健康体检、特需门诊、特需病房”三位一体的医疗保健一条龙和健康管理一体化的健康服务平台，以优质的服务、精湛的技术、便捷的流程，面向闽西南精英人士提供高品质的健康管理医学服务。1、体检一科（标准区）：设于4号楼五楼（门诊大楼），建筑面积1500平方米。一站式的健康体检服务流程，为公务员、企事业团体及个人提供标准化、高品质的健康体检服务。2、体检二科（贵宾区）：设于3号楼四楼（新内楼大楼），建筑面积3000平方米。全新装修的一站式体检服务流程和温馨的服务环境，高度信息化的健康体检和健康管理服务系统，全新的先进医疗与功能检查设备，强大的医技人才队伍，宾至如归的服务团队，为高端客户和保健对象提供个性化的深度健康体检和检后健康管理服务。3、特需门诊（知名专家门诊）：设于3号楼一至三楼，建筑面积8000平方米。汇聚医院百名德技双馨的专家团队，提供预约出诊服务；解决疑难病症及复杂病患的联合会诊；满足社会部分患者的医疗保健服务需求，缓解供需矛盾。一楼综合服务区：设有门诊住院收费处、药学部、核磁共振（MRI）等；二楼知名专家门诊区：设有内科、外科、妇产科、儿科、耳鼻咽喉科、眼科、口腔科、皮肤科、中医科和干部保健门诊等；三楼医技检查区：设有检验科、影像科（DR、CT）、超声医学科、心功能科、电子胃肠镜、胶囊内镜室、神经电生理室、营养科等。4、特需病房：设于3号楼二十一至二十二楼，设有单间、套间、家庭式套房、豪华家庭式私密套房等。