该科是九江市卫生局和医院重点建设科室，拥有专科的ICU病房，业务范围涵盖肺脏、食管、心脏、纵隔及胸壁等方面疾病的诊治，掌握纤维支气管镜、经皮肺穿刺活检、支气管动脉及肺动脉介入治疗技术，开展了肺癌的肺叶切除、全肺切除、心包内处理血管的肺切除、各种袖式肺切除，各段食管肿瘤切除，食管癌、贲门癌根治，胃、空肠、结肠代食管术，纵隔肿瘤切除，脓胸的剥脱，胸膜内胸廓改形等手术；治疗咳血方法独特；在市内率先开展电视胸腔镜手术（VATS）及体外循环心脏直视手术；已开展的心脏手术包括心脏瓣膜置换、房间隔缺损修补、室间隔缺损修补、法乐氏四联症矫治、心脏肿瘤切除术。