积极进行中西医结合治疗胆道疾病、防治结石的研究，完成了多种治疗胆道疾病的中成药的临床试验研究。先后研制出胆乐胶囊、茵莲安胆冲剂、胆囊合剂、山麦合剂（胆囊二号冲剂）、胆囊方等一批具有显著疗效的中成药，成为上海的一大特色产品。除了在中医方面具有独到之处，我科于上世纪八十年代末期，在上海市率先使用胆道镜进行胆总管检查；开展PTCD技术。上世纪九十年代初期开展ERCP检查，当时属于上海市领先专业。同期引进了腹腔镜技术，成为上海市较早开展腹腔镜胆囊切除术的单位之一。胆道外科也因此成为上海市胆道疾病诊治领先单位。2000年，黄建平主任成为第三任主任，他在原有基础上继续发展腹腔镜微创技术，将腹腔镜技术从原先局限于胆囊切除术，扩展到整个普外科手术。先后开展的国内领先的手术有：腹腔镜下胆总管探查术、腹腔镜下结直肠肿瘤根治术、腹腔镜下脾脏切除术、腹腔镜下早期胃癌根治术、腹腔镜下肝脏肿瘤切除术、腹腔镜下腹股沟疝修补术、腔镜下甲状腺手术、腔镜下腋窝淋巴结清扫术、腹腔镜下后腹膜肿块切除术、胸腔镜下肺大泡切除术、交感神经结切断术治疗手汗症等等。2002年我科与德国蛇牌学院联合成立腹腔镜培训中心，先后4次举办高级腹腔镜技术学习班，并与德国微创外科学会建立学术协作关系。此外还成立了以曙光医院、仁济医院、长征医院为基础，联合上海各医院的上海市胆道疾病会诊中心。上海胆道疾病会诊中心面向全国解决疑难胆道疾病，至今已经有20余年的历史。胆道外科先后完成《针刺对正常家兔胆囊电生理的研究》、《胆囊一号合剂对胆汁成分改变的影响》、《ERCP 后三维螺旋CT胆道重建对胆道疾病的诊断》、《腹腔镜胆总管探查术后放置自行脱落胆总管支架一期缝合胆总管的临床研究》等课题。发表论文近百篇。我科现拥有胆道镜、十二指肠镜、全套腹腔镜等高新设备，胆道疾病的检查手段从常规的超声检查、CT检查，到现在的核磁共振胆胰管造影、ERCP、三维螺旋CT胆道重建、腹腔镜等检查技术大大提高了胆道疾病的诊疗水平。