始建于五十年代，长期从事于中医中药、中西医结合防治各种肝病的临床和科研工作，在全国具有明显的学科优势，先后被确立为国家教育部重点学科（中医内科学）、国家中医药管理局中医肝病重点专科、上海市优势学科（中医内科学）、上海市首批医学领先专业、上海市中医肝病临床医学中心、上海市教委第四期重点学科、上海市卫生局中医肝病特色专科。本学科以中医药防治急、慢性病毒性肝炎为主攻方向，并开展脂肪性肝病、自身免疫性肝病的中医药临床与实验研究。建立了急性病毒性肝炎、慢性病毒性肝炎中医诊治常规和质量控制标准及丙型肝炎的辩证分型诊断标准，其中丙型肝炎的辩证分型诊断标准已作为全国学会标准在全国试行。在慢性病毒性肝炎的研究方面，2001年以来承担国家十•五攻关项目2项；部、市级项目18项；局级项目10项。中医肝病专科在临床医疗工作中扬中医之优，取西医之长，坚持中医特色，中西医结合，在国内率先提出应用补肾为主的方法治疗慢性乙型肝炎和清热解毒法治疗慢性丙型肝炎，经过长期的科研和实践，开发了治疗慢性肝病系列中药制剂和临床三类新药，如治疗慢性乙型肝炎的补肾冲剂、治疗慢性丙型肝炎的清肝冲剂、抗肝纤维化的灵甲胶囊、治疗脂肪肝的抗脂冲剂、治疗亚临床肝性脑病的清开冲剂以及胁痛的外治法肝舒贴，其中补肾冲剂、清肝冲剂、、清开冲剂曾获获上海市科委或教育部科技成果奖；开拓了中医治疗慢性肝病的新路，取得了较佳的临床疗效，在国内外产生了一定的影响。