开设于建院初期，数十年来针灸科出版中医针灸专著21部，培养研究生2人，现由全国著名老中医周志杰主任医师，出任科主任，张福会副主任医师出任副主任。全科现有6人，主任医师3人，副主任医师2人，研究生学历2人。周志杰主任医师是第三、第四批全国名老中医药专家学术经验继承工作指导老师，并出任中国针灸学会理事、陕西省针灸学会副会长、陕西省针灸临床专业委员会主任委员、西安市针灸学会理事长。张福会副主任出任中国针灸学会器材专业委员会委员、陕西省针灸学会理事、陕西省针灸临床专业委员会秘书、西安市针灸学会副秘书长。针灸科现有主任医师3名、副主任医师2人。开展针刺、艾灸、拔罐、捏脊、微波理疗、TDP理疗、康复指导及中药等治疗。擅长治疗面神经炎、脑血管病及其后遗症、多种运动障碍、多种原因引起的偏瘫和失语、多发性神经根炎、周围神经损伤性的肢体运动障碍、头痛、偏头痛、多种原因引起的眩晕、面肌痉挛、三叉神经痛，带状疱疹、睡眠障碍、胆结石、消化不良、胃肠功能紊乱、胃痉挛、顽固性呕吐、便秘、膈肌痉挛(呃逆)、单纯性肥胖病、过敏性哮喘、慢性支气管炎、前列腺炎、肾结石、颈椎病、腰腿痛、落枕、急性腰扭伤、多种软组织损伤、痛经、月经不调、乳腺增生、慢性盆腔炎、暴聋暴盲、耳鸣、美尼尔氏综合症及多种疑难杂病等。