福建省妇幼保健院病理科主要承担妇科、产科、儿外科的病理学诊断工作。现有工作人员12名，医师7名，技术员5名，其中副主医师3名，主治医师1名，住院医师3名有2名具有研究生学历。拥有自动冰冻切片机、全密封脱水机、石蜡包埋机、旋转石蜡切片机、免疫组化染色仪、新柏式液基薄层细胞制片系统一200型、彩色病理分析系统、带显微摄像头的奥林巴斯显微镜等先进设备。其中新柏式TCT(ThinPep Cytology Test)膜式超薄细胞学测试为医院2002年率先购进的先进设备，检出率均高于传统的涂片检查，广泛应用于妇女防癌普查。病理科2005年外检量达到12073份，TCT9912份，术中冰冻600份，院外会诊200例。现开展《盆腔子宫内膜异位症PDGF、BFGF、TGF-β表达的研究》、《先天性巨结肠检测方法》两个院内课题。