我院于上世纪九十年代成立消化内窥镜室，开展胃肠镜检查，随着诊断技术的不断提高，先进设备的逐步引进，现已形成融检查、治疗于一体的消化内窥镜中心。拥有日本进口潘太克斯电子胃镜、电子肠镜，德国进口爱博高频电刀治疗仪及镜下各种附件。其中内窥镜医师两名，先后在北京朝阳医院及芜湖弋矶山医院进修消化内窥镜，内窥镜护师两名，先后在宣城、芜湖市级医院进修学习，均取得内镜培训上岗证书，整合为一支诊疗及护理经验丰富的医护人员团队。开展常规电子胃镜、电子肠镜检查，无痛胃镜、无痛肠镜检查，内镜（胃镜、肠镜）下治疗等项目。