该科成立于2004年底，现有专科医师5人，其中主任医师1名、主治医师1名、住院医师3名，均拥有硕士研究生以上学历。科室环境优美、布局合理、人员齐整、设备一流，现已开放病床20张，并开设肠道门诊、发热门诊和肝炎门诊，广泛开展对急、慢性肝炎伤寒等常见传染病的筛查和诊疗工作，实现对传染病的早发现、早报告、早治疗。同时定期组织培训医务人员、积极应对霍乱、人感染高致病性禽流感等突发公共卫生事件，增强医院预防、控制传染病的能力。科室负责指导抗菌药物的临床合理应用，协同院感科、药学部等作好医院细菌耐药的监测管理工作。科室还承担厦门大学医学院五年制本科生的理论授课任务，有厦门大学医学院聘请的副教授１名。