神经内分泌科于2008年由儿科神经专科与儿科内分泌专科合并而成，对神经和内分泌疾病的联合诊治极具特色，在国内的儿童神经和内分泌领域均具有一定的影响力。　儿科神经专科是在广州地区开设最早的神经专科之一，现已发展成为中华医学会儿科分会脑科学专业委员会和发育行为学委员会的委员单位，广东省康复医学会儿童发育与康复分会会长单位，广东省脑发育与脑病防治学会发育行为学分会主任委员单位，广东医学会儿科分会神经组副组长单位，在华南地区乃至全国都具有一定影响。专科现已开展神经电生理检查、神经影像学检查、智力测定、发育评估、心理评估、运动评估，可为儿童神经、心理、精神患者提供药物治疗、心理咨询，为特殊儿童提供运动康复、心理康复、语言康复治疗。专科在小儿癫痫、脑瘫、自闭症、运动障碍、肌肉病、多动症、抽动症、多发性硬化及其它免疫相关性脑炎的诊治和科研方面积累了丰富的经验。自1996年在国内率先开展大剂量丙球治疗多发性硬化的临床研究，现已对儿童神经免疫性疾病治疗取得丰富的经验和良好的效果；利用先进的MR技术对脑病进行病理分型，并结合流式细胞仪技术对脑病进行免疫分型，进而采取不同治疗方案，大大提高了脑炎、脑瘫等治疗疗效；专科开创的自闭症BTR策略，极大提高了自闭症的临床疗效和改善了自闭症的预后；依托本科血液专科雄厚的技术力量，开展了骨髓移植治疗肾上腺脑白质营养不良、进行性肌营养不良的临床研究，为治疗这些不治之症展现了希望。儿童内分泌及遗传代谢专科是广东乃至华南地区较早开展儿童内分泌及遗传代谢疾病诊治与研究的专业。在儿童矮小症、性早熟、先天性肾上腺皮质增生症、糖尿病、肥胖、代谢综合征、甲状腺疾病、骨代谢异常、尿崩症、多种垂体激素缺乏症、性发育异常、内分泌肿瘤等疾病的治疗方面有丰富经验，积极推动儿童内分泌疾病的规范化诊治。在广东地区率先使用新技术项目，如微阵列比较基因测序及二代测序技术进行儿童神经发育性疾病及儿童罕见病的病因学研究，参与多部国家级行业指南的制定。专科开展的检查项目齐全，已开展的诊疗项目有：生长激素、性腺轴激素、甲状腺素、糖代谢等内分泌激素测定；诊断内分泌疾病的各种动态功能实验；AI辅助测骨龄及预测身高等，依托国家重点实验室，检查结果准确可靠。专科是中华医学会儿科分会儿童内分泌及遗传代谢学组委员单位，广东省医学会儿童内分泌及遗传代谢学组副组长单位。 儿科神经内分泌科，现有正高2人，副高4人，博士生导师1名，硕士导师5名，医技人员近30人。现任主任罗向阳（神经专科）教授，副主任梁立阳（内分泌及遗传代谢专科）教授。