1999年1月王俊杰教授负责筹建北医三院放射治疗科。 2001年4月，北医三院与北京冶金医院签署合作协议成立肿瘤治疗中心，同时成立放射治疗科，王俊杰教授任中心主任和放射治疗科主任。2001年-2014年，肿瘤中心分别于冶金医院和北医三院党校院区进行诊疗工作。2014年7月，肿瘤放疗科病房迁回院北医三院本部。2016年建立肿瘤放射治疗科实验室。北医三院肿瘤放疗科目前拥有国际上最先进的瓦里安Trilogy直线加速器、瑞典医科达Axesse直线加速器、Iris射波刀机器人治疗系统，瓦里安后装治疗机、全套放射性粒子植入手术设备，大孔径CT、深部热疗机等，涵盖当前肿瘤放射治疗领域所有治疗手段，能够开展当前肿瘤放射治疗所有主流技术。肿瘤放疗科成立20年来，致力于学科发展和人才培养，逐步形成完备的人才梯队，现有63名员工，其中主任医师1名、主任护师1名，副主任医师和副研究员6名、中级职称18名。科室形成了放射性粒子和头颈肿瘤学组，射波刀和胸部肿瘤学组，妇瘤和乳腺肿瘤学组，泌尿和消化肿瘤学组等特色学组。同时，医疗组、物理组、治疗组、护理组和实验室协同开展临床工作，使肿瘤的放射治疗实现系统化、精准化、专业化。肿瘤放疗科成立以来，发表论文200余篇，其中SCI文章60余篇。主编《放射性粒子组织间近距离治疗肿瘤》和《放射性粒子组织间近距离前列腺癌》第一和第二版等9部著作。承担国家科技部重点研发计划、国家自然科学基金重点项目、面上项目、青年项目，首都临床特色应用研究重点项目、博士后科学基金等项目。王俊杰主任获教育部高校科技进步二等奖、华夏医学科技三等奖，2015-017年当选北京医学会放射肿瘤专业委员会主任委员，2017年当选中华医学会放射治疗分会候任主任委员。肿瘤放疗科建立以来注重学术交流和人才培养，每年有20余次科室内的学术讲座和读书报告活动。举办北京市放射肿瘤年会两届，举办全国性粒子治疗肿瘤学习班23届，每年接受进修医师4批，举办妇科肿瘤综合规范化治疗学习班6届，泌尿肿瘤培训班1届，培养全国各地近3000名临床医师。北京大学第三医院肿瘤放射治疗科20年来一直秉持创新发展理念，追随和引领肿瘤放射治疗学科发展的潮流，披荆斩棘，栉风沐雨，治疗手段不断丰富，患者服务水平持续提高，成为中国乃至世界知名的放射治疗中心。