第三人民医院检验科设有临床生化室、临床免疫室、临床微生物实验室、分子生物学实验室、HIV初筛实验室、临床血液体液室及血库7个组室，共有职工25人，其中高级职称2人，中级职称12人。 第三人民医院检验科拥有多种世界先进的仪器设备，如美国BECKMAN公司 LX20全自动生化分析仪、美国JOHNSON ﹠JOHNSON 公司VITROS ECI全自动免疫分析系统、VITROS250全自动生化分析仪、瑞士ROCHE公司LIGHTCYCLE荧光PCR定量测定仪、法国STAGO公司COMPACT全自动血凝分析仪、美国ABBOTT公司 I2000全自动荧光免疫分析系统、美国BECKMAN公司ARRAY360特种蛋白分析仪、美国BD公司9120全自动血培养仪、日本SYSMEX公司 血细胞分析仪、美国BIO-RAD公司VARIANT高压液相分析仪、法国MINI-VIDAS荧光酶免分析仪、丹麦雷度公司血气分析仪、瑞士ROCHE公司电解质分析仪等世界一流的检验分析仪器。成功开展了临床血液体液、临床生化、临床微生物、激素、临床分子生物学、性病病原学和HIV等多种项目的检测，对肾病、自身免疫性疾病、肝病、传染病、内分泌疾病、消化疾病、心血管疾病、骨代谢疾病、血液病、肿瘤疾病等提供实验室诊断依据，并陆续跟踪世界先进的实验室诊断技术，为病人提供更全面、更优质的服务。 第三人民医院检验科在日常工作及上海市室内、室间、盲点质控评估活动中圆满完成各项质控工作，以质量第一，服务第一的原则严格管理，不断完善，先后获得了《兴华杯》标兵示范窗口、上海市医务工会文明班组称号、上海市总工会上海市文明班组称号、上海市卫生系统先进文明班组称号、上海第二医科大学共青团号、上海第二医科大学样板窗口、上海市卫生系统规范服务示范窗口、上海交通大学医学院文明科室等多项荣誉。