消化内科为北京军区重点学科，为南开大学医学院硕士学位授权点。王东旭副院长是该科学科带头人，博士后，毕业于美国斯坦福大学医学院，现为南开大学医学院兼职教授、硕士生导师。科内配有奥林巴斯电子胃镜、日本富士能超声内窥镜、微波内窥镜治疗系统等先进设备。该科对消化道出血镜下止血治疗、胆石症、急慢性胰腺炎及消化道早期癌内镜以及超生内镜检查技术在北京军区和天津地区处于领先地位。 专科特色有：ERCP、消化道出血镜下止血、无痛胃肠镜检查、食管静脉曲张内镜下套扎、消化道狭窄扩张及支架植入、内镜下超声检查、消化道早期癌超声内镜检查和微创治疗等，早期食管、胃肠道肿瘤的内镜下切除术在北京军区和天津地区享有很高声誉。