南京鼓楼医院医学心理科成立于2003年。目前有临床医生8名，均拥有博士或硕士学位，其中高级职称4名。本科室目前治疗的主要病种包括抑郁症、焦虑症、失眠症、强迫症、躯体形式障碍，治疗方法包括药物及心理咨询等。日门诊量在200人次左右，一直以来为江苏省及周边省市提供专业而优质的心理卫生服务。同时医学会心理科是南京大学医学院、徐州医科大学、南京中医药大学教学实习基地。