南京脑科医院儿童心理卫生研究中心成立于1984年，其前身南京脑科医院儿童精神科成立于1978年, 是我国第一所儿童心理卫生专业机构，由陶国泰教授出任首任中心所长。1986年被世界卫生组织聘任为世界卫生组织儿童心理卫生科研和培训合作中心，至2007年已连续六次被聘任为世界卫生组织的合作中心。1988年起被国家卫生部任命为中国儿童心理卫生指导中心，是卫生部儿童心理卫生专业人员培训基地。 目前儿童中心主要由三个部分组成：儿童心理卫生门诊、儿童康复部、儿童精神科住院部。儿童心理卫生门诊中开设了儿童心理卫生普通门诊、专家门诊、儿童心理咨询和心理治疗门诊、多动症、孤独症等专科门诊。儿童康复部内设有儿童少年心理评估室、儿童孤独症教育和行为干预中心、感觉统合训练室、脑功能生物反馈治疗室、微量生物电治疗室、儿童潜能开发训练室。儿童精神科住院部为半开放式病房，设有20张床位，分别有家庭式病房和集体病房，融医院、学校、家庭模式为一体。 中心现有医师12名，其中主任医师4人，副主任医师4人，具有硕士及硕士以上学位者4人，他们兼任了中华医学会儿童精神医学学组副主任委员、中国心理学会科普工作委员会副主任委员、中国心理卫生协会儿童、青少年专业委员会委员、江苏省心理学会医学心理学专业委员会副主任委员、江苏省心理学会常务理事等职，中心是精神病学、应用心理学硕士点，在各种儿童心理、行为及情绪障碍的临床诊治上积累了大量的病例和丰富的经验，多项诊治水平居国内领先地位。