内蒙古医学院附属医院医学影像科的前身是放射科，成立于1958年。1985年，在自治区率先引进了CT设备，成立了CT室。1995年成立了医学影像科。1996年，引进了以色列Eiscin2.0T磁共振仪，成立了磁共振室。至此，影像科已能开展常规放射、CT、MRI影像检查和治疗。2002年，2009年被自治区卫生厅评为自治区重点学科。