儿童医院变态反应科是黑龙江省内唯一一家专业儿童变态反应科室，集检验、诊断、治疗为一体的特色科室，主要诊治儿童过敏性疾病，如支气管哮喘、过敏性咳嗽、慢性咳嗽、过敏性鼻炎、花粉症、特异性皮炎、荨麻疹、湿疹等疾病。 该科室具有经过首都儿科所哮喘防治中心及北京协和医院变态反应科正规培训的医护人员，配有肺功能仪，为哮喘诊断与治疗疗效的判断提供了科学的客观指标；经济、方便、快捷的血清总IgE测定支气管哮喘等过敏性疾病的初筛指标；体内外筛查过敏源，无痛苦，无全身反应，快捷且特异性高。体内筛查过敏源为定量试验，准确度高，不受药物及病情影响，包括IgE介导的吸入组合由IgE及IgG介导的食物组过敏源检测。哮喘急性发作期采用空气压缩泵吸入药物能快速缓解病情，减少静点及住院的几率，大大减轻患儿家长的经济负担和痛苦，节省了患儿和家长的诊治时间。峰流速仪为患者提供家庭监护保证，筒式吸舒方便了6岁以下儿童预防药物的吸入。 该科脱敏治疗，采用标准化变应原疫苗安脱达治疗螨过敏引起的过敏性鼻炎。支气管哮喘等疾病，减轻甚至完全缓解鼻炎或哮喘的症状，减少甚至停止其他对症药物的使用，预防哮喘症状恶化或过敏性鼻炎发展为哮喘，使病人的免疫系统趋于正常，疗效长久，节省治疗费用，显著提高生活质量，为世界卫生组织公认的唯一可以达到改变及缩短变应性（过敏性）疾病疗程的一种治疗方法。变态反应科的盐疗室，配有成套的由俄罗斯引进的气溶胶盐设备，治疗恢复期的支气管哮喘，久咳不愈，慢性支气管炎，过敏性鼻炎，湿疹等呼吸与皮肤变态反应系统疾病。此方法是纯天然物理疗法，无毒副作用，无痛苦，可减少患儿长期吸入激素药物的剂量和对症药物的应用。临床应用九年来治疗国内外患者十万余人次，深受广大患儿的好评。