1950年建院至1963年，传染病一直属于内科专业。1963年9月单独设立传染病区，1982年建立传染科，并增设肠道门诊。1994年，改名内三科，后相继增设了肝病门诊、发热门诊。2002年更名为感染性疾病科。 科室专家对各类感染性疾病，尤其对病毒性肝炎、肺结核的治疗、发热待查有较深的研究。科室经常开展新技术、新业务，率先在仙桃市开展干扰素抗乙肝病毒、胸腺肽a1抗乙肝病毒、拉咪呋定抗乙肝病毒、代丁抗乙肝病毒恩替卡韦抗乙肝病毒等新业务。 科室病房位于住院部一楼，开放病床42张；门诊位于门诊大楼一楼，由专家、主治医师轮流坐诊。科室配备有主任医师2人，副主任医师2人，主治医师7人，医师1人。2006年6月9日，门诊迁入感染性疾病大楼。该大楼一楼为门诊，二楼为功能室，三楼、四楼为病房。同年8月1日，传染病区的医疗服务功能整体转移到新楼，设有病床28张，可满足目前各种消化道和呼吸道等常见感染性疾病以及各种突发性传染病的诊治。