我院性病防治中心是上级部门批准的南昌市唯一一家市级性病防治中心，是国家卫生部规范化性病医疗服务门诊项目执行单位、国家卫生部在南昌市设立的性病、艾滋病检测哨点，是卫生部－欧盟共同签署的支持中国性病、艾滋病预防控制合作项目的转诊中心 中心现有主任医师5名，副主任医师8名，中级医技人员50余名，中心自成立以来共治疗各种性病患者二十多万人次，在性病的诊断和治疗方面积累了丰富的临床经验。近几年，我院性病中心开展了多项科研活动。其中，协助中国疾病疾病预防控制中心完成的《建立规范化性病医疗服务门诊》及《中国－欧盟性病艾滋病防治合作项目》受到卫生部高度评价。开展的《南昌市2003年泌尿生殖道支原体的耐药研究》等多项研究，受到市科委的重视。 中心实验室的检测水平和检测设备完全达到了国家卫生部《性病诊疗规范》中有关三级实验室的要求。设有常规化验室、免疫室、艾滋病初筛实验室、PCR实验室，开展了淋球菌镜检、培养和药敏试验、梅毒螺旋检测、支原体培养等所有性病常规化验， 开展免疫荧光、免疫酶标法，检测梅毒、生殖器疱疹、尖锐湿疣等患者体内血清抗体滴度等。同时利用激光、红光、体外射频等技术治疗各种皮肤赘生物，各种病因引起的前列腺炎、前列腺增生、肥大，宫颈炎、宫颈糜烂、阴道炎等妇科炎症。拥有全市唯一一台国内领先的EPFH-200型前列腺体外射频治疗仪，在治疗时探头无需放入患者体内，无痛苦，无引起医院感染的可能。开展了包皮环切术、巨大尖锐湿疣切除术等常规手术，以减少阴茎癌的发病率。病友不需住院既可得到满意的治疗。