南京市第一医院肿瘤科是江苏省临床重点专科，国家级药物临床试验基地，其中肿瘤外科是南京市医学重点专科，南京医科大学肿瘤学博士培养点。肿瘤外科现有高级专业技术职称人员4名，博士生导师、硕、博士4名，床位40张。该科常规开展胸腹颈部肿瘤以手术为主的规范化综合治疗。食管癌的早诊早治及微创治疗、直肠癌以保存功能为主的外科治疗和放射性粒子植入治疗恶性肿瘤是该科三大特色。手术中强调无瘤观念，能够整块切除肿瘤及累及脏器和转移淋巴结,减少术后复发的机会，且能在手术中根据患者肿瘤的分期，对中晚期患者在术中植入碘-125粒子，以减少术后复发的机率。