该科创建于1991年，经过近20年的学科建设发展，拥有内分泌病房、内分泌专科门诊、核医学科及实验室，是西部地区最完善的小儿内分泌疾病诊断治疗中心，临床诊疗技术已达到国内先进水平。目前内分泌科医师8人(教授3人、副教授2人、主治医师3人，住院医师4人)，其中，博士1人、硕士5人。诊断治疗多种小儿内分泌疾病和遗传代谢性疾病：各种小儿甲状腺疾病、儿童糖尿病、矮小症、性早熟、性发育异常(小阴茎、小睾丸、外生殖器异常、两性畸形等)、性发育延迟、尿崩症、肾上腺疾病、肥胖症、甲状旁腺疾病、骨发育、代谢异常性疾病及遗传代谢性疾病等。