南宁心理医院心理科设有心理门诊和心理科病房两部分，该科室共有医护人员24人，其中高级职称2名，中级职称6名，初级职称18名。2005年10月引进一高级心理专业人才作主任，科室具有较雄厚的心理咨询心理治疗技术力量。 心理门诊主要从事心理咨询，心理测验，门诊心理治疗业务。心理咨询包括青少年社会适应不良，学习障碍、行为问题、婚恋问题等。心理测验使用全自动心理 CT机测验，包括MMPI，韦氏智力测量、SCL-90、EPQ、抑郁、焦虑等在内的二十多个心理测验量表。门诊心理治疗有认知治疗、行为治疗、森田治疗、支持治疗、催眠治疗、生物反馈治疗、危机干预等。 该科室拥有森田病房和心理病房两个病房。心理病房设于门诊部三楼，病房宽敞明亮、整洁、舒适、环境优雅、拥有音乐治疗、生物反馈、放松训练、催眠治疗、体疗、娱乐等一整套心理咨询、心理治疗设备。森田病房坐落在风景优美，空气清新的医院后花园，她是广西第一家，也是经冈本常男理事长认可的全国唯一的一所真正符合森田诊治原则精神的森田病房。这两个病房为广大处于紧张、恐惧、失眠等神经质症及一些心理平衡、社会适应障碍、心理应激障碍、儿童心理障碍的朋友提供一个理想的治疗康复的场所。