我院新生儿病区始建于1980年，1984年被市卫生局批文成立温州市新生儿救治中心, 在省厅支持下，在美国HOPE基金会帮助下，1990年投入巨资成立了浙南地区第一个具国内先进水平、一流设备的新生儿重症监护室(NICU)，为浙江省新生儿疾病防治中心温州分中心，目前负责多项的各级科研课题工作，医技水平处于省内先进。新生儿科现有主任医师1名（温州市第五批551培养人才第二层次培养对象），副主任医师2名，主治医师和住院医师及护士25名。新生儿病房面积400m2左右，开放床位28张，包括重症监护室、早产儿室、足月儿室，每年收治新生儿1300例左右。1999年最早引进省内首台德国Babylog高频振荡呼吸机，目前已拥有多台进口常频和高频呼吸机，多台太空床头监护仪，鼻塞CPAP呼吸机3台，并配置惠普手提式临床血气、电解质分析仪、微量血糖监测仪、经皮胆红素检测仪、床头摄片机，床边头颅B超，新生儿听力筛查仪，以及进口远红外抢救台及婴儿保温箱、兰光治疗仪等多种高档监护抢救设备。医疗技术方面对极低和超低出生体重儿的管理积累了丰富经验，最小存活婴儿体重仅800克，孕周26周。开展新生儿抚触的护理和早产儿腹部按压、早产儿滴服喂养。开展经外周静脉中心静脉置管技术（PICC），熟练掌握全胃肠道外营养技术。高频呼吸机治疗呼吸衰竭及危重病人。开展新生儿肺功能监测、高压氧舱治疗缺氧缺血性脑病。换血疗法治疗重症高胆红素血症。熟练掌握经喉气管插管技术、经鼻气插管术并进行气道冲洗抢救新生儿胎粪吸入性肺炎、肺出血。鼻塞间歇正压通气。应用肺泡表面活性物质治疗新生儿呼吸窘迫综合症和胎粪吸入性肺炎。出院新生儿神经行为评估，并参与全国早产儿和低出生体重儿情况的流行病学调查。