本区有胃肠外科、血管外科与血管腔内外科两个专业组。胃肠外科主要从事胃肠道疾病诊疗工作，应用内窥镜处理各种消化道疾病是其特色。学科带头人李良庆主任（福建省内窥镜学组副主任委员，硕士研究生导师，留美学者）在省内最早开展经鼻胰胆管引流、胆管取石、镜下十二指肠乳头切开成形术及胆管内支架植入术。内镜下大肠息肉摘除例数居省内之冠。血管外科与血管腔内外科主要从事动脉、静脉、淋巴管及其相关性疾病的诊疗工作，在各种动脉瘤、肢体缺血、内脏缺血、缺血性脑中风、急性肺动脉栓塞、自体干细胞移植、化学性腰交感神经节切除及静脉曲张的微创治疗等有特色。年专科门诊量4000余例，开放手术800余例，腔内诊疗500余例。是省内能够独立开展血管开放手术与腔内治疗的唯一专业组。学科带头人郭平凡主任（福建省普外科、心胸血管外科专业组委员、医学博士、硕士研究生导师）主持的Hybrid治疗胸腹主动脉瘤达到国内先进水平，主动脉腔内治疗、下肢动脉介入治疗、肺动脉机械碎栓例数居省内之首。该专业组常年保持与欧美及国内主要血管病治疗中心学术交流。本区医护人员秉承救死扶伤的宗旨，自觉履行质量、安全、服务、费用理念，努力营造和谐的医患氛围。