厦门市第二医院普外科为我院传统科室，开展了普外科疾病手术，如胃肠癌根治术、结直肠癌根治术、胆囊及胆道疾病的手术治疗、肿瘤的手术治疗、甲状腺切除术、乳腺癌根治术、胰腺疾病如胰十二指肠联合切除术等，并开展了腹腔镜下胆囊切除术、胆总管切开取石及双频双脉冲激光碎石取石术，以及腹腔镜下甲状腺瘤摘除术，肝肾囊肿开窗引流术、阑尾切除术、粘连性肠梗阻松解术、结直肠癌根治术等。