功能科包括彩超室、B超室、心电图室、脑电图室、纤维胃镜室、肺功能室等。主要对小儿心血管、呼吸、消化、神经、生殖以及内分泌系统疾病进行辅助诊断。每年接待患儿两万多人次。现有工作人员9名，其中主任医师1名、副高级职称1名，中级职称6名。 目前开展了小儿心脏彩色超声多谱勒、头颅和腹部B超、常规心电图、动态心电图、常规脑电图、长程脑电图和动态脑电图；纤维胃镜；过敏仪对过敏原的检测和治疗；肺功能检测等检查项目。