心胸外科起步于上世纪50年代，现发展成为能够诊治几乎所有心胸外科常见疾病专科。擅长开展先天性心脏病矫治、风湿性心脏病、心瓣膜病的心瓣膜置换、冠心病的冠脉搭桥等复杂手术，心脏手术病人最小年龄10个月，最大年龄67岁。该科尤其在复杂先心病和重症瓣膜外科手术方面积累了丰富的临床经验。该科在普胸外科诊治方面，能够根据肺癌、食道癌临床分期以及个体化治疗的原则，开展以手术治疗为主，术前新辅助化疗、术后辅助化疗、放疗以及免疫治疗为辅的综合治疗，为肺癌、食道癌患者提供全程一站式服务;还能够开展胸腔镜微创手术、食道支架植入、气管支架植入术，对不能手术的晚期食道癌采用食道支架植入+放疗取得一定的疗效。该科的体外循环心内直视手术曾获广铁集团公司科技进步三等奖，并有多项成果获医院的科技新技术奖。2005年11月，该科成为国际扶轮社在广东开展救心行动的指定医疗机构，专门为贫困的先心病儿童免费进行救治。