福建省第二人民医院消化内科于1993年成立，是国家脾胃重点专科建设单位，福建省中医脾胃病重点专科，卫生部中药新药临床药理研究基地。拥有福建省重点脾胃病研究室，福建省重点脾胃实验室、脾胃病专科门诊、病区及消化内镜室，开展无痛胃肠镜检查，超声内镜、放大内镜，胃肠道息肉内镜下息肉切除术，胆总管结石内镜取石术，碳13呼气幽门螺杆菌菌检测，碳13呼气肝功能、胰腺功能检测等项目。创制有胃炎一号、二号口服液，春波益肾潜阳胶囊、口服液、清化胃饮、清化肠饮、仙叶合剂和清化灭幽胶囊、十香止痛贴、七味消胀贴等药， 年均门诊6.0万人次，病区床位35张，年收治患者800人次。在学科带头人杨春波名老中医的带领下，将传统中医与现代科技相结合，运用中医综合治疗的手段，治疗各种消化系统疾病。