儿童保健科属于医院保健部下设的一级大科。下设二级科室：儿童康复科、儿童营养科、儿童心理卫生科、儿童普通保健科、儿童眼保健科、儿童耳鼻咽喉科、口腔保健科。开展主要业务:儿童康复科：对高危儿进行早期干预包括运动障碍的训练、视力、听力、语言训练、感觉统合训练。儿童营养科：开展儿童营养性疾病如矮小症、肥胖、性早熟的诊治，儿童营养评估及膳食营养指导。儿童心理卫生科：开展儿童心理行为测试、0-3岁儿童早期智能开发、儿童心理障碍诊治。其他业务有儿童入托入园体检、体弱儿管理；儿童屈光不正及弱视、斜视的筛查、儿童眼科常见病的诊治；儿童龋齿防治、补牙、拔牙、窝沟封闭、牙周病、洁牙、儿童口腔黏膜病的诊治；婴幼儿听力筛查、脑干诱发电位检测验、指导弱听儿的康复训练；新生儿游泳、抚触等。无锡市新生儿疾病筛查分中心也设在儿童保健科，主要进行新生儿听力筛查、先天性甲状腺功能减症及苯丙酮尿症的筛查及管理，以及阳性患儿的确诊及治疗。儿童保健科近年来一项科研获市科技进步三等奖、一项科研获市科技进步四等奖，发表论文共11篇，其中核心期刊3篇，统计源期刊2篇，省级期刊4篇，市级期刊2篇。