应急管理部应急总医院感染内科创建于2003年，由医院从相关临床科室抽调临床经验丰富的医生和护士组成。目前设有肠道门诊和隔离观察室，主要开展急性腹泻的诊疗、急性发热性疾病的筛查和转运，以及其他传染性疾病的监控和预防，并承担新冠核酸检测工作，在抗击SARS和新型冠状病毒感染中，发挥了重要作用。